De eerste Gary’s Muffins werd in 1993, in een klein winkeltje op de Prinsengracht in Amsterdam, gevestigd door Gary, een Amerikaanse immigrant, die oorspronkelijk naar Nederland kwam voor zijn carrière als professionele balletdanser.
Gary maakte gebruik van zijn eigen recepten en die van zijn moeder, en ontwikkelde zo een lijn van Amerikaanse producten (muffins, brownies, cheesecake, etc.), die hij introduceerde op de Nederlandse markt.
In de winkel hing de zonnige ‘California-sfeer’, met vrolijke kleuren, natuurlijke materialen en met het accent op kwaliteit, verse producten en persoonlijke service. Naast de verkoop vanuit de winkel, begon Gary een bescheiden groothandel en daarmee werd Gary’s Muffins een bekende naam.
Binnen een aantal jaar was het bedrijf gegroeid naar zeven vestigingen en een bakkerij, die al de bakproducten zelf produceerde onder de naam ‘Gary’s Home-Baked Products’.

De bagels, die oorspronkelijk uit New York werden geïmporteerd, werden nu ook in de bakkerij geproduceerd. Een ‘bagel-trainer’ kwam naar Nederland over en een lijn van speciaal gereedschap om bagels mee te maken werd naar Amsterdam verscheept. Tot op de dag van vandaag worden dezelfde originele recepten gebruikt en de bagels worden volgens het ‘Manhattan-recept’ gekookt, wat hen onderscheidt van alle andere gestoomde bagels die er op andere plekken in Nederland worden verkocht.

In 2003 werden de winkels verkocht aan verschillende eigenaren en de bakkerij werd aan de bakkers zelf verkocht, onder de voorwaarde dat de kwaliteit van de producten onveranderd zou blijven. De winkel aan de Kinkerstraat bleef van Gary en de menuselectie en openingstijden werden uitgebreid. Refererend aan Gary’s eigen levenservaring werd er een ‘Italiaans tintje’ aan toegevoegd. Gary’s Italiaanse vrouw en haar moeder, Nonna Ietta, hebben eindelijk toegestemd om hun traditionele familierecepten vrij te geven. Nu is er dan ook een selectie Italiaanse maaltijden, waaronder Lasagne, Canneloni en Stufato, te verkrijgen bij de winkel aan de Kinkerstraat, die nu Gary’s Deli wordt genoemd.

De sfeer in de winkel is nog steeds vriendelijk en ‘casual’, mede dankzij de managers Pepijn en Tessa, die al meer dan zes jaar bij Gary’s werken en de traditie in ere houden.